RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 STK17AQ9UEE5 414 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 LILRA1O75019 489 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 SCTRP47872 440 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVK-9P63128 1117 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 USP4Q13107 963 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 EML3Q32P44 896 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 ITPKCQ96DU7 683 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMP2P16035 220 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CYLDQ9NQC7 956 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM52Q96A61 297 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SIRT1Q96EB6 747 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 WIPF1O43516 503 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CDCA8Q53HL2 280 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 NOD1Q9Y239 953 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CBLBQ13191 982 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZVU0 165 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM47Q96LD4 638 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SENP2Q9HC62 589 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2IP78347 998 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CLDN10P78369 228 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE2CQ5TA81 110 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM50Q86XT4 487 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ADH1AP07327 375 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RASA1P20936 1047 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OGFOD1Q8N543 542 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP1A2P50993 1020 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PTK7Q13308 1070 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MEIOBQ8N635 442 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM196BA6NMK8 535 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L15C9J2P7 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L10C9JJH3 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L12C9JPN9 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L11C9JVI0 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L21D6R901 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L18D6R9N7 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L22D6RA61 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L19D6RCP7 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L20D6RJB6 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 DKK1O94907 266 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ATG7O95352 703 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 GNRH1P01148 92 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PTGIRP43119 386 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RELBQ01201 579 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L24Q0WX57 530 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC102BQ68D86 513 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KIFC2Q96AC6 838 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SCNN1DP51172 638 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PSME1Q06323 249 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SIX5Q8N196 739 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PRU2 124 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 GDF10P55107 478 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ARXQ96QS3 562 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP1P13497 986 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms