RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370408.2

ERLIN1-201, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene ERLIN1, Length 962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-201ENST00000370408 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ERLIN1-201ENST00000370408 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.14■■■□□ 2.42
ERLIN1-201ENST00000370408 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.14■■■□□ 2.42
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.14■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.13■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.12■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.11■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
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ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF827Q17R98 1081 aa30.07■■■□□ 2.4
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ERLIN1-201ENST00000370408 NSD2O96028 1365 aa30.05■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.05■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 KCNQ4P56696 695 aa30.04■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 POLKQ9UBT6 870 aa30.04■■■□□ 2.4
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ERLIN1-201ENST00000370408 MTFR1LQ9H019 292 aa30.02■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 PAPPAQ13219 1627 aa30.01■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.01■■■□□ 2.39
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ERLIN1-201ENST00000370408 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.99■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 CYP27B1O15528 508 aa29.99■■■□□ 2.39
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ERLIN1-201ENST00000370408 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.96■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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ERLIN1-201ENST00000370408 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.92■■■□□ 2.38
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ERLIN1-201ENST00000370408 SYT17Q9BSW7 474 aa29.89■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.88■■■□□ 2.37
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ERLIN1-201ENST00000370408 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.88■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.375e-7■■□□□ 11.4
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ERLIN1-201ENST00000370408 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
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ERLIN1-201ENST00000370408 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
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ERLIN1-201ENST00000370408 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.72■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.71■■■□□ 2.35
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ERLIN1-201ENST00000370408 ITGB4P16144 1822 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.69■■■□□ 2.34
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ERLIN1-201ENST00000370408 MSL1Q68DK7 614 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.68■■■□□ 2.34
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ERLIN1-201ENST00000370408 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
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ERLIN1-201ENST00000370408 AK7Q96M32 723 aa29.67■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.66■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
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ERLIN1-201ENST00000370408 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.66■■■□□ 2.34
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ERLIN1-201ENST00000370408 C5P01031 1676 aa29.65■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ITPK1Q13572 414 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 DCAF5Q96JK2 942 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ATP6V1AP38606 617 aa29.63■■■□□ 2.33
ERLIN1-201ENST00000370408 MTHFSP49914 203 aa29.62■■■□□ 2.33
ERLIN1-201ENST00000370408 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.62■■■□□ 2.33
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