RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365336.1

RNU6-169P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 169, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-169P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZFP42Q96MM3 310 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-169P-201ENST00000365336 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-169P-201ENST00000365336 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 ADH1AP07327 375 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 EML3Q32P44 896 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 UCN2Q96RP3 112 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 SENP2Q9HC62 589 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP17L5A8MUK1 530 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 ATP9BO43861 1147 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 PTGIRP43119 386 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 NCOA4Q13772 614 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZNF787Q6DD87 383 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 NOD1Q9Y239 953 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 A0A1W2PRU2 124 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 POTECB2RU33 542 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 MEN1O00255 615 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 RFX1P22670 979 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 KIFC2Q96AC6 838 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 NLRP3Q96P20 1036 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP17L3A6NCW0 530 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP17L4A6NCW7 530 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPINT1O43278 529 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 GNRH1P01148 92 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 PSME1Q06323 249 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 TRIM50Q86XT4 487 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 TRIM47Q96LD4 638 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-169P-201ENST00000365336 TTLL8A6PVC2 850 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 MAN1A2O60476 641 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 GTF2IP78347 998 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 RASA1P20936 1047 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ATP1A2P50993 1020 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CDCA8Q53HL2 280 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CNKSR1Q969H4 720 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SOBPA7XYQ1 873 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 GDF10P55107 478 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CLN3Q13286 438 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 OGFOD1Q8N543 542 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 XAGE2Q96GT9 111 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CENPCQ03188 943 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 IL2RAP01589 272 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 INHAP05111 366 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CCDC102BQ68D86 513 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ARID3AQ99856 593 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 GPC1P35052 558 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 CLDN10P78369 228 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 BACH1O14867 736 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-169P-201ENST00000365336 SCNN1DP51172 638 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms