RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357525.5

PLN-201, Transcript of phospholamban, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLN, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLN-201ENST00000357525 GABBR2O75899 941 aa9.9□□□□□ -0.82
PLN-201ENST00000357525 SOX11P35716 441 aa9.9□□□□□ -0.82
PLN-201ENST00000357525 SKIP12755 728 aa9.9□□□□□ -0.82
PLN-201ENST00000357525 PTPREP23469 700 aa9.9□□□□□ -0.82
PLN-201ENST00000357525 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PLN-201ENST00000357525 CLCN6P51797 869 aa9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 GPR153Q6NV75 609 aa9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 KIF3BO15066 747 aa9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 PLXNC1O60486 1568 aa9.88□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 C7P10643 843 aa9.88□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 SSFA2P28290 1259 aa9.88□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.88□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 ZMYM3Q14202 1370 aa9.88□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L5A8MUK1 530 aa9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 GIPC2Q8TF65 315 aa9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.86□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 HSPA2P54652 639 aa9.86□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.86□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L15C9J2P7 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L10C9JJH3 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L12C9JPN9 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L11C9JVI0 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L21D6R901 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L18D6R9N7 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L22D6RA61 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L19D6RCP7 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L20D6RJB6 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 USP17L24Q0WX57 530 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 KCNH2Q12809 1159 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 NPATQ14207 1427 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 RNF40O75150 1001 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 KCNK17Q96T54 332 aa9.85□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 NCOA4Q13772 614 aa9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 PNMA1Q8ND90 353 aa9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 ABCC5O15440 1437 aa9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.84□□□□□ -0.83
PLN-201ENST00000357525 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 NR1H3Q13133 447 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 MROH2AA6NES4 1674 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 C3P01024 1663 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 LGR5O75473 907 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 CFHP08603 1231 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 RASA1P20936 1047 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.83□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 DAPK1P53355 1430 aa9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.82□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.81□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.81□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 PTK7Q13308 1070 aa9.81□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 KIF15Q9NS87 1388 aa9.81□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 PTPRKQ15262 1439 aa9.81□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.81□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 FAM196BA6NMK8 535 aa9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ZBBXA8MT70 800 aa9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ATP2B4P23634 1241 aa9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 DOK7Q18PE1 504 aa9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.8□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.79□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.79□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 MAP10Q9P2G4 905 aa9.79□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ERBINQ96RT1 1412 aa9.79□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ABL1P00519 1130 aa9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 TCF3P15923 654 aa9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 NCOA1Q15788 1441 aa9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 POTEIP0CG38 1075 aa9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PLN-201ENST00000357525 PRMT3O60678 531 aa9.77□□□□□ -0.85
PLN-201ENST00000357525 ATP6V1AP38606 617 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms