RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 KDRP35968 1356 aa27.07■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 HMOX1P09601 288 aa27.07■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.06■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 SOCS7O14512 581 aa27.02■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.926e-9■■■■■ 29.3
RAB11B-201ENST00000328024 ANP32CO43423 234 aa27.02■■□□□ 1.92
RAB11B-201ENST00000328024 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.01■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 NUDCQ9Y266 331 aa27■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC184Q52MB2 194 aa26.99■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 CYP27B1O15528 508 aa26.99■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.96■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.96■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 SPG7Q9UQ90 795 aa26.96■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 BCL9O00512 1426 aa26.95■■□□□ 1.91
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.95■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.95■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM37O94972 964 aa26.94■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.94■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 SBF2Q86WG5 1849 aa26.93■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 PRKAR2BP31323 418 aa26.92■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 KCNQ2O43526 872 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 PHKG2P15735 406 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 FCHSD2O94868 740 aa26.9■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
RAB11B-201ENST00000328024 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.89■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC125Q86Z20 511 aa26.86■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.86■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.84■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.84■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.84■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.84■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 NHSQ6T4R5 1651 aa26.83■■□□□ 1.89
RAB11B-201ENST00000328024 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.82■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 MRS2Q9HD23 443 aa26.81■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 APBA3O96018 575 aa26.8■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.8■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.8■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.8■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.78■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 DCAF5Q96JK2 942 aa26.78■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 MIER1Q8N108 512 aa26.77■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 LGR6Q9HBX8 967 aa26.77■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.76■■□□□ 1.88
RAB11B-201ENST00000328024 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 BTAF1O14981 1849 aa26.75■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 ITGB4P16144 1822 aa26.75■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 BAG6P46379 1132 aa26.74■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 PIGBQ92521 554 aa26.74■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.74■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 MAP3K5Q99683 1374 aa26.72■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.72■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 IL17REQ8NFR9 667 aa26.72■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.72■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.71■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.71■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 PLSCR1O15162 318 aa26.71■■□□□ 1.87
RAB11B-201ENST00000328024 PROM2Q8N271 834 aa26.7■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.69■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 NFE2L2Q16236 605 aa26.69■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 RUNDC1Q96C34 613 aa26.69■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.69■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 NEFMP07197 916 aa26.68■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.68■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 CABP4P57796 275 aa26.67■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 DCTN1Q14203 1278 aa26.67■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.67■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 MCM10Q7L590 875 aa26.66■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.65■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.65■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.64■■□□□ 1.86
RAB11B-201ENST00000328024 MRC1P22897 1456 aa26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms