RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLI2P10070 1586 aa27.56■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CUL4AQ13619 759 aa27.56■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNAI1P63096 354 aa27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDCL2Q8N4E4 241 aa27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD7Q92527 254 aa27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFT57Q9NWB7 429 aa27.55■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.54■■■□□ 2
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.53■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.53■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.53■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEK4P51957 841 aa27.52■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP25Q9UHP3 1055 aa27.52■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.52■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKAR2BP31323 418 aa27.52■■■□□ 2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NFE2L2Q16236 605 aa27.51■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAF3Q5VWG9 929 aa27.51■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.51■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHD1O14646 1710 aa27.5■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF853P0CG23 659 aa27.5■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZFYVE9O95405 1425 aa27.49■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM177BA6PVY3 158 aa27.49■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTIFO43310 598 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPNDQ8N594 471 aa27.48■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MBIPQ9NS73 344 aa27.48■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP10DQ9P241 1426 aa27.48■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.48■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FEZ1Q99689 392 aa27.48■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.47■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC183Q5T5S1 534 aa27.46■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP48Q86UV5 1035 aa27.46■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL34Q8N239 644 aa27.46■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.46■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1524Q8TCG1 905 aa27.46■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPDYE4A6NLX3 237 aa27.45■■□□□ 1.99
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP85Q6P2H3 762 aa27.44■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM4AO75164 1064 aa27.43■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPM3P06753 285 aa27.43■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASXL2Q76L83 1435 aa27.43■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTL1A6NKG5 1358 aa27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MCCP23508 829 aa27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.42■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANAPC15P60006 121 aa27.41■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MX1P20591 662 aa27.41■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.41■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OGFRQ9NZT2 677 aa27.4■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.4■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCHHQ07283 1943 aa27.4■■□□□ 1.98
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYCP1Q15431 976 aa27.38■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL17RAQ96F46 866 aa27.38■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.38■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNF1Q9H3M0 494 aa27.38■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.37■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APBB1O00213 710 aa27.37■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.37■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PYCARDQ9ULZ3 195 aa27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGS12O14924 1447 aa27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM51Q9NW97 253 aa27.36■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE1AP54750 535 aa27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FUCA2Q9BTY2 467 aa27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPATQ14207 1427 aa27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.35■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMOX1P09601 288 aa27.34■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.33■■□□□ 1.97
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