RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 GNAI3P08754 354 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 SIL1Q9H173 461 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 ERICH2A1L162 156 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 STK3Q13188 491 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 STARD3NLO95772 234 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS3-201ENST00000296051 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 C8orf37Q96NL8 207 aa16.02■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 F6X3S4 739 aa16■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 ZPR1O75312 459 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 GNAI2P04899 355 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 MCM2P49736 904 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 ATP2B2Q01814 1243 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 TRIM29Q14134 588 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 CAMK4Q16566 473 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 KLHL40Q2TBA0 621 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 RNF20Q5VTR2 975 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 FSD1Q9BTV5 496 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 ASXL2Q76L83 1435 aa16■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 SDF4Q9BRK5 362 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 TNRQ92752 1358 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 CUL7Q14999 1698 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 MCM10Q7L590 875 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 MSH6P52701 1360 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.97■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 FAM83GA6ND36 823 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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HPS3-201ENST00000296051 NFE2L2Q16236 605 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 CNTROBQ8N137 903 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS3-201ENST00000296051 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CCDC192P0DO97 292 aa15.95■□□□□ 0.14
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HPS3-201ENST00000296051 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 NUCB1Q02818 461 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 IGSF3O75054 1194 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 TNMDQ9H2S6 317 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 MNS1Q8NEH6 495 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 ERICH4A6NGS2 130 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 DTNBO60941 627 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 SRGAP3O43295 1099 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 SMC2O95347 1197 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 ACEP12821 1306 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-201ENST00000296051 ADCY5O95622 1261 aa15.91■□□□□ 0.14
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