RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 NBPF4Q96M43 638 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 RTL1A6NKG5 1358 aa23.39■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 CDCA8Q53HL2 280 aa23.37■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.37■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.36■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.36■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 SYT17Q9BSW7 474 aa23.36■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 LY75O60449 1722 aa23.36■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 AKT1S1Q96B36 256 aa23.35■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.35■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.34■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.34■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 NSD2O96028 1365 aa23.34■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.33■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 ARXQ96QS3 562 aa23.33■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.33■■□□□ 1.33
TNNT1-201ENST00000291901 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.32■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 INSRP06213 1382 aa23.31■■□□□ 1.32
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TNNT1-201ENST00000291901 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.31■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 FLT4P35916 1363 aa23.3■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.3■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.3■■□□□ 1.32
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TNNT1-201ENST00000291901 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 KLHL34Q8N239 644 aa23.28■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.28■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.28■■□□□ 1.32
TNNT1-201ENST00000291901 ITGB4P16144 1822 aa23.24■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.24■■□□□ 1.31
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TNNT1-201ENST00000291901 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.24■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.24■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.24■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.24■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.24■■□□□ 1.31
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TNNT1-201ENST00000291901 MSH5O43196 834 aa23.23■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.23■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 CHD4Q14839 1912 aa23.23■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.22■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 CYP27B1O15528 508 aa23.22■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 POLD1P28340 1107 aa23.22■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.22■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.21■■□□□ 1.31
TNNT1-201ENST00000291901 UTRNP46939 3433 aa23.2■■□□□ 1.3
TNNT1-201ENST00000291901 MAP3K5Q99683 1374 aa23.19■■□□□ 1.3
TNNT1-201ENST00000291901 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
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TNNT1-201ENST00000291901 PALLDQ8WX93 1383 aa23.17■■□□□ 1.3
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TNNT1-201ENST00000291901 EYA1Q99502 592 aa23.16■■□□□ 1.3
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TNNT1-201ENST00000291901 SPG7Q9UQ90 795 aa23.13■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 NCAPD2Q15021 1401 aa23.13■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 C4BP0C0L5 1744 aa23.12■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 PIGBQ92521 554 aa23.12■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 SMIM5Q71RC9 77 aa23.09■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 PANK3Q9H999 370 aa23.08■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.08■■□□□ 1.29
TNNT1-201ENST00000291901 PHF14O94880 888 aa23.07■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.07■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 AK7Q96M32 723 aa23.07■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.06■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 PHKG2P15735 406 aa23.05■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.05■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.05■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.04■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.03■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.282e-9■■□□□ 13.7
TNNT1-201ENST00000291901 SIK1P57059 783 aa23.03■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.02■■□□□ 1.28
TNNT1-201ENST00000291901 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 ATP6V1AP38606 617 aa22.99■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 ITPK1Q13572 414 aa22.99■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 ATG3Q9NT62 314 aa22.99■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.99■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 MORC1Q86VD1 984 aa22.98■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 GNPATO15228 680 aa22.96■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.96■■□□□ 1.27
TNNT1-201ENST00000291901 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.96■■□□□ 1.27
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