RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD11A6QL63 1104 aa24.93■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 MYL6BP14649 208 aa24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11FIP3O75154 756 aa24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 ERLIN1O75477 346 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 MX1P20591 662 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K11Q16584 847 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 SYCP1Q15431 976 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 SMTNL1A8MU46 457 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 STRN4Q9NRL3 753 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.89■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRHP07919 91 aa24.89■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 WASF1Q92558 559 aa24.89■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 MPNDQ8N594 471 aa24.89■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 ERLIN2O94905 339 aa24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 DEF6Q9H4E7 631 aa24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 SOGA3Q5TF21 947 aa24.87■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.87■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.86■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 SYCE3A1L190 88 aa24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC181Q5TID7 509 aa24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 TDO2P48775 406 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.83■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.83■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 HMGXB3Q12766 1538 aa24.83■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.83■■□□□ 1.57
CCSAP-201ENST00000284617 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.575e-7■■■■■ 32.4
CCSAP-201ENST00000284617 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 NESP48681 1621 aa24.82■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.82■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 IQCEQ6IPM2 695 aa24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEF3O95398 923 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K1Q13233 1512 aa24.8■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 MCM10Q7L590 875 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 NCOA1Q15788 1441 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 DDX11Q96FC9 970 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2B2Q01814 1243 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 FERMT3Q86UX7 667 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 AIDAQ96BJ3 306 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC5O15440 1437 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-201ENST00000284617 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP100Q494V2 611 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 ANO10Q9NW15 660 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN4Q92575 508 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms