RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.26■■□□□ 1.79
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UBE2B-201ENST00000265339 FAM83GA6ND36 823 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA2Q08379 1002 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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UBE2B-201ENST00000265339 WDR63Q8IWG1 891 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.18■■□□□ 1.78
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UBE2B-201ENST00000265339 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
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UBE2B-201ENST00000265339 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.14■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 STRN4Q9NRL3 753 aa26.14■■□□□ 1.77
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UBE2B-201ENST00000265339 IL16Q14005 1332 aa26.08■■□□□ 1.77
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UBE2B-201ENST00000265339 ZNF853P0CG23 659 aa25.99■■□□□ 1.75
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UBE2B-201ENST00000265339 CHL1O00533 1208 aa25.91■■□□□ 1.74
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UBE2B-201ENST00000265339 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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