RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.77■■■□□ 2.2
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CITED1-201ENST00000246139 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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CITED1-201ENST00000246139 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.26■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.25■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
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