RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 INSRP06213 1382 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 FLT4P35916 1363 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 PANK3Q9H999 370 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 BTAF1O14981 1849 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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HOXC6-201ENST00000243108 NBPF14Q5TI25 921 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 POLKQ9UBT6 870 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 TXNRD1Q16881 649 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 NCAPD2Q15021 1401 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 CASZ1Q86V15 1759 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXC6-201ENST00000243108 NSD2O96028 1365 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 PAPPAQ13219 1627 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 EYA1Q99502 592 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.34
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HOXC6-201ENST00000243108 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 LY75O60449 1722 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 CYP27B1O15528 508 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC184Q52MB2 194 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 SLC15A2Q16348 729 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 KCNQ4P56696 695 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 MORC1Q86VD1 984 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 STK32BQ9NY57 414 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 ITGB4P16144 1822 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 MRS2Q9HD23 443 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF827Q17R98 1081 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 RALBP1Q15311 655 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 SPON1Q9HCB6 807 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB7AO95365 584 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 AKT1S1Q96B36 256 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.26■■□□□ 1.31
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HOXC6-201ENST00000243108 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 PTGER2P43116 358 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 PHKG2P15735 406 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 IL13P35225 146 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 PIGBQ92521 554 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 C5P01031 1676 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
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HOXC6-201ENST00000243108 MTHFSP49914 203 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PALLDQ8WX93 1383 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 MTFR1LQ9H019 292 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 KDRP35968 1356 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 UTRNP46939 3433 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 C4BP0C0L5 1744 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.11■■□□□ 1.29
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