RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 LRRC37A3O60309 1634 aa20.55■□□□□ 0.88
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TMED1-201ENST00000214869 CRB1P82279 1406 aa20.54■□□□□ 0.88
TMED1-201ENST00000214869 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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TMED1-201ENST00000214869 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.53■□□□□ 0.88
TMED1-201ENST00000214869 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.53■□□□□ 0.88
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TMED1-201ENST00000214869 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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TMED1-201ENST00000214869 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.32■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 USP21Q9UK80 565 aa20.31■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 CACNA1FO60840 1977 aa20.3■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 VAMP4O75379 141 aa20.29■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 NEFLP07196 543 aa20.29■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.29■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.29■□□□□ 0.84
TMED1-201ENST00000214869 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.29■□□□□ 0.84
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