RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 RSC1A1Q92681 617 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NUDT9Q9BW91 350 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 STK33Q9BYT3 514 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CARD9Q9H257 536 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 OGFRQ9NZT2 677 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.51□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 GRID2O43424 1007 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KRT86O43790 486 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TIAF1O95411 115 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CTPS1P17812 591 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ERCC2P18074 760 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TNFAIP3P21580 790 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 VAV2P52735 878 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 STC1P52823 247 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CDH6P55285 790 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 LAMB3Q13751 1172 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 INSCQ1MX18 579 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 VWA3BQ502W6 1294 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RAB43Q86YS6 212 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NPWQ8N729 165 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MR1Q95460 341 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SCAMP4Q969E2 229 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SGSM3Q96HU1 749 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CD180Q99467 661 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RAB33BQ9H082 229 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZWILCHQ9H900 591 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FANCEQ9HB96 536 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NOD2Q9HC29 1040 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.5□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ITPR3Q14573 2671 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 A0A0J9YYE9 177 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TLCD2A6NGC4 264 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PRSS44E7EML9 344 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF185O15231 689 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NUAK1O60285 661 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SCRG1O75711 98 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 GFPT2O94808 682 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TRBC1P01850 177 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PRF1P14222 555 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 VCLP18206 1134 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ITGA3P26006 1051 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SERPINB6P35237 376 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PTGER4P35408 488 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MMP13P45452 471 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TUBB4BP68371 445 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PTP4A2Q12974 167 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TUBB2AQ13885 445 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KYNUQ16719 465 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MON1BQ7L1V2 547 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CPT1BQ92523 772 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 C19orf60Q96EN9 201 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 LRFN5Q96NI6 719 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 IP6K3Q96PC2 410 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RUFY1Q96T51 708 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.49□□□□□ -1.05
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