RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TPSAB1Q15661 275 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPUQ71F23 418 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 EXTL1Q92935 676 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PDXPQ96GD0 296 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.441e-7■■■□□ 16.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM4Q9C037 500 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NFS1Q9Y697 457 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD36A6QL64 1941 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K6O95382 1288 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC4O95801 387 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ITIH1P19827 911 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL4CP56559 192 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NFKB2Q00653 900 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX44Q53QW1 395 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 OGFOD3Q6PK18 319 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT222Q8N1A0 295 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 HMCESQ96FZ2 354 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC25Q96NG3 672 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH12Q9NPG4 1184 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PISDQ9UG56 409 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 APPL1Q9UKG1 709 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 LOXL2Q9Y4K0 774 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MATN3O15232 486 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF6O95976 241 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPCP11150 499 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 DTX1Q86Y01 620 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNJLQ8IV13 435 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G15Q8NCC3 412 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC2Q96KP1 924 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIM3Q96PE6 472 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 STRADBQ9C0K7 418 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17BQ9UHF5 180 aa24.01■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 RIPK2O43353 540 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 CTSEP14091 401 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN3P26045 913 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP12P39900 470 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SUOXP51687 545 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOAP61586 193 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 SERINC3Q13530 473 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 HIF1AQ16665 826 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 UGP2Q16851 508 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP15Q460N3 678 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CERCAMQ5T4B2 595 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR5Q6UX68 686 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 USP53Q70EK8 1073 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 GKN2Q86XP6 184 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SLITRK4Q8IW52 837 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PDIK1LQ8N165 341 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 HCAR2Q8TDS4 363 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM74Q96NL1 305 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RUFY1Q96T51 708 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAAQ9Y263 795 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM202A6NGA9 273 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 RASA4O43374 803 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF10O60809 474 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL18O95568 372 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD2P08910 425 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MLNP12872 115 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 GM2AP17900 193 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA4P43358 317 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD51Q06609 339 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ELP6Q0PNE2 266 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND2CQ68D51 928 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRED1Q7Z699 444 aa23.99■■□□□ 1.43
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