RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628177.1

snoR1.1-201, humanhuman

BASIC

Gene snoR1, Length 80 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
snoR1.1-201ENST00000628177 MPP5Q8N3R9 675 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ZNF491Q8N8L2 437 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SCAIQ8N9R8 606 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 POC5Q8NA72 575 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 AQP11Q8NBQ7 271 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 AGBL3Q8NEM8 1001 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 EXD1Q8NHP7 514 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 RHOXF1Q8NHV9 184 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 AFAP1L1Q8TED9 768 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 C2CD4CQ8TF44 421 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 NSMAFQ92636 917 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 HPS3Q969F9 1004 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 RNF183Q96D59 192 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 APIPQ96GX9 242 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MAGED4Q96JG8 741 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CEP295NLQ96MC4 621 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 PCYT2Q99447 389 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 LGMNQ99538 433 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MAP3K3Q99759 626 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 PAXXQ9BUH6 204 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CCSER1Q9C0I3 900 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 IKZF5Q9H5V7 419 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 GORASP2Q9H8Y8 452 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MED20Q9H944 212 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 AS3MTQ9HBK9 375 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 NOD2Q9HC29 1040 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CNGB3Q9NQW8 809 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 PANK4Q9NVE7 773 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SLC52A1Q9NWF4 448 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TMOD4Q9NZQ9 345 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TMEM9Q9P0T7 183 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 UPB1Q9UBR1 384 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 PADI3Q9ULW8 664 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 LZTS1Q9Y250 596 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 DTNAQ9Y4J8 743 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 STON1Q9Y6Q2 735 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa-0.43□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SDK2Q58EX2 2172 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SHANK1Q9Y566 2161 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 A0A0U1RQS6 177 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 A0A1W2PN81 502 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 A0A1W2PPL8 197 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SHTN1A0MZ66 631 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 A8MXK9 166 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 KCNN4O15554 427 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TMCC2O75069 709 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TSC22D2O75157 780 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SH3BGRLO75368 114 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 GPC4O75487 556 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 RGS11O94810 467 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MT-ND5P03915 603 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 DANCRP0C864 163 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 FAM200BP0CF97 657 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 HSD3B1P14060 373 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TCF3P15923 654 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 GABRB3P28472 473 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ATICP31939 592 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CHRNA7P36544 502 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MMP12P39900 470 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 TNFRSF4P43489 277 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 KIR2DS4P43632 304 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MTNR1AP48039 350 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 LMAN1P49257 510 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 PDE1BQ01064 536 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 SP3Q02447 781 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 GUCY2DQ02846 1103 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CREB5Q02930 508 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MBTD1Q05BQ5 628 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 FCHO2Q0JRZ9 810 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 GPR17Q13304 367 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ACVR2BQ13705 512 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CAPSQ13938 189 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CSHL1Q14406 222 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 DECR1Q16698 335 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 CHRFAM7AQ494W8 412 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 GXYLT1Q4G148 440 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 ESCO2Q56NI9 601 aa-0.44□□□□□ -2.48
snoR1.1-201ENST00000628177 LCN10Q6JVE6 187 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms