RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTC30AQ86WT1 665 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF354CQ86Y25 554 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 KATNAL2Q8IYT4 538 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM199Q8N511 208 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM71BQ8TC56 605 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 IRGQQ8WZA9 623 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 EID2BQ96D98 161 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SENP8Q96LD8 212 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GAD1Q99259 594 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ACBD6Q9BR61 282 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 APOL6Q9BWW8 343 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBXN6Q9BZV1 441 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAB17Q9H0T7 212 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYBUQ9NX95 663 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAFFQ9ULX9 164 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 USP22Q9UPT9 525 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HES2Q9Y543 173 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYO7AQ13402 2215 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCNTO95613 3336 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIAA0355O15063 1070 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MDM4O15151 490 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP8B1O43520 1251 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 BUB1O43683 1085 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAMP2O60895 175 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SRGAP2O75044 1071 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 B3GAT3O94766 335 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 OAZ2O95190 189 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ESRRBO95718 433 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 C1RP00736 705 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 F9P00740 461 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TIMP1P01033 207 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM200BP0CF97 657 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT3P12035 628 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSD3B1P14060 373 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RRM1P23921 792 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SDC4P31431 198 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC5A2P31639 672 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CHRNA3P32297 505 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP2C18P33260 490 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HTR7P34969 479 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCK1P35558 622 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERPINF1P36955 418 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPD2P43304 727 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGEA11P43364 429 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPN9P43378 593 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FNTAP49354 379 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GATMP50440 423 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLCNKBP51801 687 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAMLD1Q13495 774 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CUL1Q13616 776 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FHL2Q14192 279 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPRRQ15256 657 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP1B1Q16678 543 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 C4orf46Q504U0 113 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 C8orf74Q6P047 294 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 WDR93Q6P2C0 686 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 Q6YL49 198 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms