RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	BIVM	Q86UB2	503 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MICU3	Q86XE3	530 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SCAMP4	Q969E2	229 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MAP3K14	Q99558	947 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TIMP4	Q99727	224 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CDT1	Q9H211	546 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	POLH	Q9Y253	713 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WWV3	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ACKR2	O00590	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PEX1	O43933	1283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RFPL1	O75677	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SUN1	O94901	812 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CD1A	P06126	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MAL	P21145	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CD82	P27701	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	HTR1E	P28566	365 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	UGT1A3	P35503	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	GNAQ	P50148	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KRT83	P78385	493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PTPRR	Q15256	657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	STARD8	Q92502	1023 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NRGN	Q92686	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	POLE	Q07864	2286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SCAMP1	O15126	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	YY2	O15391	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RAD1	O60671	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ATP2C2	O75185	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TDP2	O95551	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OLFM2	O95897	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CHEK2	O96017	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCL4	P13236	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TCN2	P20062	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PDC	P20941	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	IST1	P53990	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MFAP3	P55082	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	EVC	P57679	992 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCL7	P80098	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ART3	Q13508	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ODF1	Q14990	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms