RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 FIGNQ5HY92 759 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PQLC3Q8N755 202 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD6Q8NC69 237 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC11Q96DB2 347 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TGM7Q96PF1 710 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC23A2Q9UGH3 650 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CROTQ9UKG9 612 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087X0T9 212 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SMTNL1A8MU46 457 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EM74 188 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN7O94888 489 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM228BP0C875 321 aa25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT6Q8NCL4 622 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR26Q8NDV2 337 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 FAF2Q96CS3 445 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA16Q9BXB7 569 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD3Q9Y597 815 aa25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 MX2P20592 715 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC19A1P41440 591 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPHS1P49903 392 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R40P59535 323 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB17Q13105 803 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTD1Q8N815 330 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNYQ8ND76 341 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C1Q96RD1 312 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD8Q9H0E9 1235 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM39Q9HCM9 518 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 MTA2O94776 668 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 VIPP01282 170 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PIRTP0C851 137 aa25.26■■□□□ 1.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 PDK2Q15119 407 aa25.26■■□□□ 1.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 ELMO2Q96JJ3 720 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRE3Q9BY15 652 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0754O94854 1291 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A1P02730 911 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GP1BBP13224 206 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 AMD1P17707 334 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DCDC1P59894 354 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ERV3-1Q14264 604 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM135Q86UB9 458 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM48Q8IWZ4 208 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RSC1A1Q92681 617 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYATL1Q969I3 302 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MIB2Q96AX9 1013 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIB3Q96RU7 358 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZK1P1A8MUH7 402 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR89AB7ZAQ6 455 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MTSS1O43312 755 aa25.24■■□□□ 1.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 MTX2O75431 263 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PROSCO94903 275 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA10O95299 355 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3O95983 291 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINC1P01008 464 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPING1P05155 500 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR89BP0CG08 455 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 BRAFP15056 766 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKBIBQ15653 356 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGRP3Q8IV61 690 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF547Q8IVP9 402 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAM1L1Q8N609 369 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP41Q9BYV8 373 aa25.24■■□□□ 1.63
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