RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ASCL1	P50553	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	IRAK1	P51617	712 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	NEK4	P51957	841 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	EMP3	P54852	163 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MLF1	P58340	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	NUCB2	P80303	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	POU4F3	Q15319	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PSMF1	Q92530	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	KAT2A	Q92830	837 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64	4e-8	■□□□□ 11.1
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772		Q9UFV3	132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MATN3	O15232	486 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	VEGFD	O43915	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	USP1	O94782	785 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN9	O95484	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	THBS1	P07996	1170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	EPHB2	P29323	1055 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	IDUA	P35475	653 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	LIMS1	P48059	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ARFIP2	P53365	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	LOXL3	P58215	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ANAPC15	P60006	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FOXL1	Q12952	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	DTNB	O60941	627 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ALOX12B	O75342	701 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	UBXN7	O94888	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MT-CO1	P00395	513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CEACAM5	P06731	702 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	IVL	P07476	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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