RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	P3H4	Q92791	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NKD1	Q969G9	470 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	WDR24	Q96S15	920 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	VAT1	Q99536	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KCNJ13	O60928	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	AMD1	P17707	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	IDS	P22304	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CSF2RB	P32927	897 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A3	P35503	534 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MC2R	Q01718	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MC1R	Q01726	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	IHH	Q14623	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GPR26	Q8NDV2	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TRIB3	Q96RU7	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	HACD3	Q9P035	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	RAD1	O60671	282 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PMPCB	O75439	489 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PIRT	P0C851	137 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	HAL	P42357	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SPA17	Q15506	151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TBR1	Q16650	682 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CHP1	Q99653	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743		A6NCN8	305 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CHUK	O15111	745 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CST8	O60676	142 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	UBXN7	O94888	489 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	EML2	O95834	649 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	EPO	P01588	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	COMT	P21964	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	HMGCL	P35914	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CCR10	P46092	362 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	KCNC4	Q03721	635 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	KAZN	Q674X7	775 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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