RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC52A2Q9HAB3 445 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM160Q9NX00 188 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 THEGQ9P2T0 379 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GGA2Q9UJY4 613 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FEM1BQ9UK73 627 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LIPT1Q9Y234 373 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ERBINQ96RT1 1412 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KIF24Q5T7B8 1368 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0U1RQV5 110 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQ67 120 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FUOMA2VDF0 154 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SMCO2A6NFE2 343 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF716A6NP11 495 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KBTBD13C9JR72 458 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 H0YJX3 145 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 H3BUI4 141 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RASGRF2O14827 1237 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AIM2O14862 343 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF185O15231 689 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VEGFDO43915 354 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJB6O75190 326 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TOM1L1O75674 476 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINI2O75830 405 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RASSF9O75901 435 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CABYRO75952 493 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRT36O76013 467 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MFN2O95140 757 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PGLSO95336 258 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LGI1O95970 557 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 APOA1P02647 267 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CSF1P09603 554 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM86B2P0C5J1 330 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF735P0CB33 412 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARP10275 920 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MLNP12872 115 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GNSP15586 552 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NPR1P16066 1061 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PSMA5P28066 241 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CD1BP29016 333 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC5A2P31639 672 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GRK5P34947 590 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SPAM1P38567 509 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN9P43378 593 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CDKN1BP46527 198 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CAPZA2P47755 286 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GABRB2P47870 512 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH1A3P47895 512 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CASP4P49662 377 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ACTR3P61158 418 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2HP62256 183 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R2BQ00005 443 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GUCY1A3Q02108 690 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GLO1Q04760 184 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SCN1BQ07699 218 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TEFQ10587 303 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LCP2Q13094 533 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ART3Q13508 389 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC12A1Q13621 1099 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC58Q4VC31 144 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms