RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 USP29Q9HBJ7 922 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 A0A0G2JN53 185 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 A6NLC8 198 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 WNT7AO00755 349 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 OTX2P32243 289 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SHMT1P34896 483 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CD151P48509 253 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NAE1Q13564 534 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MZT2AQ6P582 158 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ITFG1Q8TB96 612 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 AP2M1Q96CW1 435 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SLC32A1Q9H598 525 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 C8orf4Q9NR00 106 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DHRS7Q9Y394 339 aa8.4□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MSCO60682 206 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 MIPP30301 263 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 OR7D4Q8NG98 312 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 TNFRSF10BO14763 440 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 FPGTO14772 594 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ALG10Q5BKT4 473 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ZNF627Q7L945 461 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 CREG2Q8IUH2 290 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.4□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 RBP1P09455 135 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ECHS1P30084 290 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 TGFB2P61812 414 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 HSPB3Q12988 150 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 GPAT4Q86UL3 456 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 C12orf66Q96MD2 445 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 CLN6Q9NWW5 311 aa8.39□□□□□ -1.07
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PDPR-210ENST00000568530 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ACOT9Q9Y305 439 aa8.39□□□□□ -1.07
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PDPR-210ENST00000568530 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 TNS2Q63HR2 1409 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 E7EQ34 232 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 H7C0S8 307 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 C9P02748 559 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 PTNP21246 168 aa8.39□□□□□ -1.07
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PDPR-210ENST00000568530 FPGSQ05932 587 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 C4orf22Q6V702 233 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.39□□□□□ -1.07
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PDPR-210ENST00000568530 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.39□□□□□ -1.07
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PDPR-210ENST00000568530 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 NDC1Q9BTX1 674 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 IDSP22304 550 aa8.39□□□□□ -1.07
PDPR-210ENST00000568530 CMPK1P30085 196 aa8.39□□□□□ -1.07
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