RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK5	Q6P3R8	708 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HOOK3	Q86VS8	718 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MCU	Q8NE86	351 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OR7G3	Q8NG95	312 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GLMP	Q8WWB7	406 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RY11	Q96G91	374 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF479	Q96JC4	524 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CNDP1	Q96KN2	507 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RUFY1	Q96T51	708 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM7	Q9C029	511 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCG8	Q9H221	673 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HRH4	Q9H3N8	390 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM206	Q9H813	350 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	USP29	Q9HBJ7	922 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ASAH2	Q9NR71	780 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CNIH4	Q9P003	139 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS18	Q9P253	973 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ABI3	Q9P2A4	366 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AURKC	Q9UQB9	309 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM17	Q9Y577	477 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC72	A6NJI9	287 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KPNA7	A9QM74	516 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L23	D6RBM5	183 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		M0QZQ0	153 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	INPPL1	O15357	1258 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RIPK2	O43353	540 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VEGFD	O43915	354 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DAB1	O75553	588 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HEXA	P06865	529 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GALT	P07902	379 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NGFR	P08138	427 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CD63	P08962	238 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM225B	P0DP42	221 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ADRA2C	P18825	462 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TACR3	P29371	465 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCND2	P30279	289 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CDA	P32320	146 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SOAT1	P35610	550 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PBX1	P40424	430 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ASMT	P46597	345 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ4	P48050	445 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC1	P48995	793 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SULT1E1	P49888	294 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP9	P55211	416 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R50	P59544	299 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4A11	Q02928	519 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SGCG	Q13326	291 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DNASE1L3	Q13609	305 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT24	Q2M2I5	525 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	P3H1	Q32P28	736 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CBWD6	Q4V339	395 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX35	Q5T0J7	233 aa		2.82	□□□□□ -1.96

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