RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF7Q14155 803 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC29A2Q14542 456 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADALQ6DHV7 355 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCRL6Q6DN72 434 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBCBQ99426 244 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUSP26Q9BV47 211 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 STRA6Q9BX79 667 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLOD4Q9HC38 313 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLK1Q9UKI8 766 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUMA1Q14980 2115 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL12A1Q99715 3063 aa8.81□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPRJQ12913 1337 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 A1L4Q6 167 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP2C2O75185 946 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ONECUT2O95948 504 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 NTSR1P30989 418 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIPAP38571 399 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPBP1Q86WP2 473 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPARTQ8N0X7 666 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEFB119Q8N690 84 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 HVCN1Q96D96 273 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTUB2Q96DC9 234 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCED1BQ96HM7 432 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACOX2Q99424 681 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYT15Q9BQS2 421 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM5Q9C035 493 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL21RQ9HBE5 538 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.8□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 POM121BA6NF01 834 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 F8VP50 259 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 FLRT2O43155 660 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CACNG3O60359 315 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 HUS1O60921 280 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 INMTO95050 263 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV3-19P01714 112 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSHRP16473 764 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP3CCP48454 512 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 LHX1P48742 406 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLCN2P51788 898 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAD2Q05329 585 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP9Q49MG5 647 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYCT1Q8N699 235 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF152Q8N8N0 203 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 WBP2Q969T9 261 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 P2RY11Q96G91 374 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLIN2Q99541 437 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM9Q9C026 710 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDH9Q9ULB4 789 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.79□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM92AA1XBS5 289 aa8.78□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.78□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZAR1LA6NP61 321 aa8.78□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRRT4C9JH25 899 aa8.78□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB27BO00194 218 aa8.78□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 COCHO43405 550 aa8.78□□□□□ -1
USP3-AS1-204ENST00000559861 CER1O95813 267 aa8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms