RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 NAGSQ8N159 534 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 MDM1Q8TC05 714 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ZNF398Q8TD17 642 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ARL5AQ9Y689 179 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 DXOO77932 396 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 FGGP02679 453 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 F3P13726 295 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 MSH3P20585 1137 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CCL7P80098 99 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CHRNA6Q15825 494 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SFRP1Q8N474 314 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PBKQ96KB5 322 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 TLR10Q9BXR5 811 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CFAP99D6REC4 459 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CEP104O60308 925 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 METTL18O95568 372 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CPNE6O95741 557 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ITGALP20701 1170 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CCKBRP32239 447 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 INHBCP55103 352 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 GDF10P55107 478 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CLDN6P56747 220 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CDH17Q12864 832 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 GPR33Q49SQ1 333 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PIM3Q86V86 326 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 MARCH9Q86YJ5 346 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SLC38A3Q99624 504 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 APOL2Q9BQE5 337 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 THSD1Q9NS62 852 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 KLC4Q9NSK0 619 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 KIF5CO60282 957 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 IDSP22304 550 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ALDH4A1P30038 563 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 MAZP56270 477 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 GABREP78334 506 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 MAP9Q49MG5 647 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 IYDQ6PHW0 289 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 OR10G6Q8NH81 332 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 STYXQ8WUJ0 223 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 ASB8Q9H765 288 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 KCNK6Q9Y257 313 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SPEGQ15772 3267 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 AKT1P31749 480 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 EPHA4P54764 986 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 B4GALNT1Q00973 533 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 HHEXQ03014 270 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 NFATC2Q13469 925 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SQSTM1Q13501 440 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 WASH2PQ6VEQ5 465 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SNX20Q7Z614 316 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 FGF11Q92914 225 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 WASH6PQ9NQA3 447 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PRKAB1Q9Y478 270 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 MYLKQ15746 1914 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 SCN8AQ9UQD0 1980 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX3-202ENST00000539804 A0A1W2PQM1 296 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX3-202ENST00000539804 H7C0S8 307 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX3-202ENST00000539804 BRINP1O60477 761 aa23.89■■□□□ 1.41
PITX3-202ENST00000539804 SNX2O60749 519 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms