RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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TSNARE1-208ENST00000524325 P2RY12Q9H244 342 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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TSNARE1-208ENST00000524325 A6NNZ2 444 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-208ENST00000524325 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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