RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 RNF114Q9Y508 228 aa7.17□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.17□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.17□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 A8MX80 341 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 ECEL1O95672 775 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 PYGLP06737 847 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 SFTPCP11686 197 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CR2P20023 1033 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CA4P22748 312 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MMP13P45452 471 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GPR3P46089 330 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CDH6P55285 790 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CNGA3Q16281 694 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MANEAQ5SRI9 462 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MARC1Q5VT66 337 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 DENND2CQ68D51 928 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CBLL1Q75N03 491 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 TEKT4Q8WW24 435 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HSPH1Q92598 858 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 DTD2Q96FN9 168 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 SCRN2Q96FV2 425 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MGME1Q9BQP7 344 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 LGR4Q9BXB1 951 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 TEX101Q9BY14 249 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CDH19Q9H159 772 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 NOD2Q9HC29 1040 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MAFKO60675 156 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 PRAMEF10O60809 474 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 PGLSO95336 258 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP46-208ENST00000512656 IVLP07476 585 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 HGFP14210 728 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GM2AP17900 193 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP46-208ENST00000512656 ETV3P41162 512 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 GPR1P46091 355 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP46-208ENST00000512656 MAPK10P53779 464 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 EPHB1P54762 984 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 OR1D5P58170 312 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP46-208ENST00000512656 Q6ZVL8 140 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP46-208ENST00000512656 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 USP7Q93009 1102 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 IQCDQ96DY2 449 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 TRIM7Q9C029 511 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 ISCUQ9H1K1 167 aa7.15□□□□□ -1.26
USP46-208ENST00000512656 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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