RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLCL2Q9UPR0 1127 aa5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 NFS1Q9Y697 457 aa5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 LCTP09848 1927 aa5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 J3QW42 95 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 WNT7AO00755 349 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 GPR171O14626 319 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAP2K7O14733 419 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 LCA5LO95447 670 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MATN4O95460 622 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 KRT7P08729 469 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 ABHD2P08910 425 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 ATF6P18850 670 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 BCAT1P54687 386 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 NADK2Q4G0N4 442 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 SPDYAQ5MJ70 313 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MTSS1LQ765P7 747 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 CHST9Q7L1S5 443 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 KCNK18Q7Z418 384 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMEM192Q8IY95 271 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 DSELQ8IZU8 1212 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MINDY1Q8N5J2 469 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRPV3Q8NET8 790 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 BBS10Q8TAM1 723 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 DUSP19Q8WTR2 217 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 GLMPQ8WWB7 406 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 CKAP2Q8WWK9 683 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 SELENOMQ8WWX9 145 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 C1orf159Q96HA4 380 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAGED4Q96JG8 741 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SNX22Q96L94 193 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 NSMCE2Q96MF7 247 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 SPATA33Q96N06 139 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 MGME1Q9BQP7 344 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 C1orf43Q9BWL3 253 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 PNPOQ9NVS9 261 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF236Q9UL36 1845 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRBC2A0A5B9 178 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC37A4O43826 429 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 CRCPO75575 148 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC15A1P46059 708 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 DGKEP52429 567 aa5□□□□□ -1.61
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TRAPPC11-208ENST00000511955 HIKESHIQ53FT3 197 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5□□□□□ -1.61
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