RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NCSTN	Q92542	709 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NTAN1	Q96AB6	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SP110	Q9HB58	689 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511		J3KR12	359 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	KATNA1	O75449	491 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM5	P06731	702 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT3	P12035	628 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DES	P17661	470 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DLST	P36957	453 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY8	P40145	1251 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN9	P43378	593 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	POLD2	P49005	469 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SCNN1B	P51168	640 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MC2R	Q01718	297 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ERV3-1	Q14264	604 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	AFMID	Q63HM1	303 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PELI3	Q8N2H9	469 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2M4	Q96R27	311 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	POLH	Q9Y253	713 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DAPK3	O43293	454 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF11	O60813	436 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL1	O75677	317 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	GPD1	P21695	349 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RGR	P47804	291 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK1D	P48730	415 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TPI1	P60174	286 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK3	Q00526	305 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ID3	Q02535	119 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXM1	Q08050	763 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NFATC2	Q13469	925 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SQSTM1	Q13501	440 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MAN2A1	Q16706	1144 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	BMPER	Q8N8U9	685 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF31	Q96EP0	1072 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX101	Q9BY14	249 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	APMAP	Q9HDC9	416 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EM74	188 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DFFA	O00273	331 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FUCA1	P04066	466 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	IVL	P07476	585 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP8	P22894	467 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ETV3	P41162	512 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	STAT5A	P42229	794 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR1	P46091	355 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NDST2	P52849	883 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	HHEX	Q03014	270 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CNGA3	Q16281	694 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF677	Q86XU0	584 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ10A	Q96MF6	247 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NDST4	Q9H3R1	872 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PDF	Q9HBH1	243 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP4	O75096	1905 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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