RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 KLHL29Q96CT2 875 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CALML4Q96GE6 196 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 VILLO15195 856 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 TACC1O75410 805 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CCNDBP1O95273 360 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 DNTTP04053 509 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 GALTP07902 379 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CHRM4P08173 479 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 PCNAP12004 261 aa4□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 TTI2Q6NXR4 508 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 TMEM81Q6P7N7 255 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SZRD1Q7Z422 152 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 TAGAPQ8N103 731 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 FRMD1Q8N878 549 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 ASCL2Q99929 193 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SLF1Q9BQI6 1058 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 HAUS8Q9BT25 410 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 AP1M1Q9BXS5 423 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SLC7A10Q9NS82 523 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 OGFRQ9NZT2 677 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 MPP6Q9NZW5 540 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 MKLN1Q9UL63 735 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 AMDHD2Q9Y303 409 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 NOTCH2Q04721 2471 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 NR5A2O00482 541 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 TSPAN9O75954 239 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 CSH2P0DML3 217 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CDC73Q6P1J9 531 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 MOB3CQ70IA8 216 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 DSELQ8IZU8 1212 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 CPXM2Q8N436 756 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 SCFD2Q8WU76 684 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SMARCE1Q969G3 411 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 LRR1Q96L50 414 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 WDFY2Q96P53 400 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 MUC13Q9H3R2 512 aa3.99□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 LIPT2A6NK58 231 aa3.98□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 AGAP14A8MT82 685 aa3.98□□□□□ -1.77
CLTC-208ENST00000496076 SEC14L2O76054 403 aa3.98□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
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CLTC-208ENST00000496076 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
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