RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 STX3Q13277 289 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATG16L1Q676U5 607 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 KLC3Q6P597 504 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 KCNJ9Q92806 393 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 COPS8Q99627 209 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 NEMP2A6NFY4 417 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 WNT9AO14904 365 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DLX3O60479 287 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRIM16O95361 564 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 PYGLP06737 847 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DCDC1P59894 354 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ACAP2Q15057 778 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DET1Q7L5Y6 550 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SPATA21Q7Z572 469 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ISCA2Q86U28 154 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 PELI3Q8N2H9 469 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DNASE1L2Q92874 299 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 COQ10AQ96MF6 247 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 HDAC8Q9BY41 377 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 COL4A2P08572 1712 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 NPC1O15118 1278 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 C6P13671 934 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 COL9A1P20849 921 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.855e-8■■■□□ 17.7
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC26A3P40879 764 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 CLCN7P51798 805 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 AP2M1Q96CW1 435 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 OXSMQ9NWU1 459 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1W2PP55 124 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SHISA7A6NL88 538 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ARRB2P32121 409 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 COPAP53621 1224 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TFF2Q03403 129 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF284Q2VY69 593 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SDE2Q6IQ49 451 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DEFB123Q8N688 67 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RDH11Q8TC12 318 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DTD2Q96FN9 168 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 GABRG3Q99928 467 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 NPHS2Q9NP85 383 aa20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 H0Y858 1186 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRIM13O60858 407 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SERPINE1P05121 402 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 HOXB2P14652 356 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 IL9P15248 144 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 DRD1P21728 446 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 NSG1P42857 185 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 OCRLQ01968 901 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 OR4D1Q15615 310 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 EXT2Q93063 718 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ULK4Q96C45 1275 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 MID2Q9UJV3 735 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 CKAP5Q14008 2032 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1W2PQF6 199 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 PSMD11O00231 422 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TSPAN12O95859 305 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 RBP1P09455 135 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 AKT1P31749 480 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC1A6P48664 564 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 TAS2R38P59533 333 aa20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1-209ENST00000491569 ITIH4Q14624 930 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms