RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491064.5

CTDSP1-210, Transcript of CTD small phosphatase 1, human

TSL 3

Gene CTDSP1, Length 786 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSP1-210	ENST00000491064	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ING2	Q9H160	280 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CARD9	Q9H257	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FBN2	P35556	2912 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	LRCH4	O75427	683 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	RNF8	O76064	485 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PTPN4	P29074	926 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CAPZB	P47756	277 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	EPHB1	P54762	984 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	IHH	Q14623	411 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	KRT31	Q15323	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	POLQ	O75417	2590 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SPTB	P11277	2137 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064		H3BRJ5	948 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	DPM1	O60762	260 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CEACAM4	O75871	244 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PRL	P01236	227 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ARL4A	P40617	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SPINT3	P49223	89 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	POLE	Q07864	2286 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	IL1R2	P27930	398 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PTGIR	P43119	386 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	UBE2H	P62256	183 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ITK	Q08881	620 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TUBB3	Q13509	450 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	SEC16A	O15027	2179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	MTA2	O94776	668 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTDSP1-210	ENST00000491064	BRAF	P15056	766 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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