RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNJLQ8IV13 435 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 NAGSQ8N159 534 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35F6Q8N357 371 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAAF3Q8N9W5 541 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 NXPE2Q96DL1 559 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PDLIM2Q96JY6 352 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRN3Q9H3W5 708 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ASB8Q9H765 288 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB6BQ9NRW1 208 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 FKBPLQ9UIM3 349 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 KCTD3Q9Y597 815 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 CHUKO15111 745 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAMEF1O95521 474 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC2A4P14672 509 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SEPT6Q14141 434 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ISXQ2M1V0 245 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 C4orf22Q6V702 233 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 MDM1Q8TC05 714 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PATE1Q8WXA2 126 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 KLC4Q9NSK0 619 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SRP72O76094 671 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 MSH3P20585 1137 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH4A1P30038 563 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 CDH17Q12864 832 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PRUNE1Q86TP1 453 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 CRLS1Q9UJA2 301 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ACACBO00763 2458 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5K4A6NMS3 321 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 LDB2O43679 373 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 VCLP18206 1134 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGALP20701 1170 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 AKT1P31749 480 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL22P35268 128 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ1P48048 391 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 CLCNKAP51800 687 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMB3Q13751 1172 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 POU6F1Q14863 301 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 RTP5Q14D33 572 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 DDHD1Q8NEL9 900 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 STYXQ8WUJ0 223 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TIMM29Q9BSF4 260 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SMOXQ9NWM0 555 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PQM1 296 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ13O60928 360 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 APRTP07741 180 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR3P46089 330 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SEMA5AQ13591 1074 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GSE1Q14687 1217 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 IYDQ6PHW0 289 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM220Q6QAJ8 160 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRED1Q7Z699 444 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC9B2Q86UD5 537 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 RASGEF1CQ8N431 466 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ULK4Q96C45 1275 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 DCUN1D1Q96GG9 259 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM74Q96NL1 305 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 DKK4Q9UBT3 224 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JNG1 304 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 KIR2DS3K7RE56 304 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CASC3O15234 703 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 PPM1DO15297 605 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR39O43194 453 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SUN1O94901 812 aa19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms