RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FAM159BA6NKW6 160 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADM5C9JUS6 153 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TOR1AO14656 332 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HDAC3O15379 428 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TGFB1I1O43294 461 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PI15O43692 258 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 BNIP3LO60238 219 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CNTN5O94779 1100 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KCNK2O95069 426 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MFN2O95140 757 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SNAPINO95295 136 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SEC24AO95486 1093 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TGM6O95932 706 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GSRP00390 522 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ASGR2P07307 311 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KRT7P08729 469 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.12□□□□□ -1.27
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PKP4-211ENST00000481115 IL7P13232 177 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HSD17B1P14061 328 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GLULP15104 373 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CD33P20138 364 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
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PKP4-211ENST00000481115 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 IL12RB1P42701 662 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PTPN9P43378 593 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NOVP48745 357 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ATP4BP51164 291 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADCY7P51828 1080 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MYL6P60660 151 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CXCR4P61073 352 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GCNT1Q02742 428 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FOXM1Q08050 763 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 INCA1Q0VD86 236 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TCP10Q12799 353 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MAP4K2Q12851 820 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NME3Q13232 169 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MAMLD1Q13495 774 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GALEQ14376 348 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.271e-13■■■□□ 19
PKP4-211ENST00000481115 TAZQ16635 292 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GRTP1Q5TC63 336 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADCK1Q86TW2 530 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PPM1NQ8N819 430 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HERVK_113Q902F9 699 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FIG4Q92562 907 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ISL2Q96A47 359 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RNF170Q96K19 258 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FAM20AQ96MK3 541 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZNF778Q96MU6 729 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PWWP2AQ96N64 755 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.12□□□□□ -1.27
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PKP4-211ENST00000481115 NAT9Q9BTE0 207 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TMEM206Q9H813 350 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CD93Q9NPY3 652 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TIGARQ9NQ88 270 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.12□□□□□ -1.27
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