RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF398	Q8TD17	642 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	VPS35	Q96QK1	796 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	KRT12	Q99456	494 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ASB8	Q9H765	288 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	GPR34	Q9UPC5	381 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	KCNK6	Q9Y257	313 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	HEATR9	A2RTY3	570 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TPP1	O14773	563 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TTI1	O43156	1089 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	GRID2	O43424	1007 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	NUAK1	O60285	661 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	AVIL	O75366	819 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CDK14	O94921	469 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CKMT2	P17540	419 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ITGAL	P20701	1170 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ADRA1D	P25100	572 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	MGAT1	P26572	445 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	AKT1	P31749	480 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	HADHA	P40939	763 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ACTR1B	P42025	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	MAGEA6	P43360	314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ACADVL	P49748	655 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CLDN6	P56747	220 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ACTR1A	P61163	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	DR1	Q01658	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	FOXC1	Q12948	553 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	PTK6	Q13882	451 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	DET1	Q7L5Y6	550 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	JAML	Q86YT9	394 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	KY	Q8NBH2	561 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SMOX	Q9NWM0	555 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SYBU	Q9NX95	663 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	GULP1	Q9UBP9	304 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	APPL1	Q9UKG1	709 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095		U3KQA8	63 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM131	Q92545	1883 aa		10.15	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	CPED1	A4D0V7	1026 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	OR2AG2	A6NM03	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	CCDC188	H7C350	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	VEGFD	O43915	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	RFPL3	O75679	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	SPINK2	P20155	84 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	MSH3	P20585	1137 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	CTSC	P53634	463 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	CDK16	Q00536	496 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	GTF2H3	Q13889	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	NR0B2	Q15466	257 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	PCID2	Q5JVF3	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	GUSBP11	Q6P575	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	DHRS13	Q6UX07	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	SNX20	Q7Z614	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	MPP5	Q8N3R9	675 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC6-222	ENST00000478095	ARL10	Q8N8L6	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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