RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 HS3ST1O14792 307 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PLPP2O43688 288 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF11O60813 436 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 MOSPD3O75425 235 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 CREG1O75629 220 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SLCO2B1O94956 709 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNK5O95279 499 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF2P09038 288 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 STX2P32856 288 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 CCR10P46092 362 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 RALGDSQ12967 914 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 HNF4GQ14541 408 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PET117Q6UWS5 81 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZTK2 550 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NRROSQ86YC3 692 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM199Q8N511 208 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 GPATCH11Q8N954 259 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP4Q96MN2 994 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 KXD1Q9BQD3 176 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 HGH1Q9BTY7 390 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NUP85Q9BW27 656 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TINAGQ9UJW2 476 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC188H7C350 402 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 ASAP2O43150 1006 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFS4O43181 175 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 DIAPH2O60879 1101 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 LCATP04180 440 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PRF1P14222 555 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NMBRP28336 390 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 BDKRB2P30411 391 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP13P45452 471 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT6P53370 316 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH13P55290 713 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TAS2R38P59533 333 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R2BQ00005 443 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PLIN5Q00G26 463 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAF1Q13077 416 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 MEP1AQ16819 746 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SYT16Q17RD7 645 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 FSCBQ5H9T9 825 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX38Q6PEX7 206 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SETD6Q8TBK2 473 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 NEK1Q96PY6 1258 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SMC6Q96SB8 1091 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRY4Q9C004 299 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMA7O14818 248 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNN4O15554 427 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRY3O43610 288 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFS7O75251 213 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 LINGO3P0C6S8 592 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PFKFB1P16118 471 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF1BP20333 461 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 UGT1A1P22309 533 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXC8P31273 242 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT2P35908 639 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NPY4RP50391 375 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MXI1P50539 228 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CTF1Q16619 201 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms