RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HDAC10Q969S8 669 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD3Q96ES6 412 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP36Q96G28 342 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TBATAQ96M53 351 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 KIFC1Q9BW19 673 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IL26Q9NPH9 171 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RAD18Q9NS91 495 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NFU1Q9UMS0 254 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DMTF1Q9Y222 760 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1A2Q9Y585 309 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LRP4O75096 1905 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MUC3AQ02505 3323 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GTW7 788 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GVT2 93 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PR77 199 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEB16A2A368 324 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 A6NNZ2 444 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 E7ESA3 106 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR39O43194 453 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 VAPBO95292 243 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS56P0CW18 603 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CD38P28907 300 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ECHS1P30084 290 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MC4RP32245 332 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HADHAP40939 763 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NBL1P41271 181 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DCDC1P59894 354 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DPTQ07507 201 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CUL1Q13616 776 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPUQ71F23 418 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM74Q86UV6 250 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SYT12Q8IV01 421 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOA3Q8NG57 546 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13H1Q8NG92 308 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF398Q8TD17 642 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UBXN4Q92575 508 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LOXL4Q96JB6 756 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 APOOQ9BUR5 198 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LGR4Q9BXB1 951 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TREX1Q9NSU2 369 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms