RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 COQ10AQ96MF6 247 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 DNAI1Q9UI46 699 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 KCNK6Q9Y257 313 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SLCO2B1O94956 709 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 CRYABP02511 175 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 TEAD1P28347 426 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 CASP1P29466 404 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 LRMPQ12912 555 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 E2F4Q16254 413 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 CATSPER1Q8NEC5 780 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 DHX58Q96C10 678 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 COQ3Q9NZJ6 369 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 EPHA6Q9UF33 1036 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 CUTAO60888 179 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 RAMP2O60895 175 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PMPCBO75439 489 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINA4P29622 427 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 RORAP35398 523 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 FOLR3P41439 243 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 GPR1P46091 355 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 MAPKAPK2P49137 400 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 HSD11B2P80365 405 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PAK1Q13153 545 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 GPR19Q15760 415 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 DENND1BQ6P3S1 775 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 KMT5CQ86Y97 462 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 TTC30BQ8N4P2 665 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 ABI3Q9P2A4 366 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ASMTLO95671 621 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 UGT1A4P22310 534 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 MST1P26927 711 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ETV3P41162 512 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 STK4Q13043 487 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PLCL1Q15111 1095 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PTCHD3Q3KNS1 767 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 CERS6Q6ZMG9 384 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM74Q86UV6 250 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 IQUBQ8NA54 791 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 DTD2Q96FN9 168 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 RAB33BQ9H082 229 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF358Q9NW07 568 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 SEMA5BQ9P283 1151 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 LHX3Q9UBR4 397 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PRKAB1Q9Y478 270 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 TGP01266 2768 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 DAB1O75553 588 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PYGMP11217 842 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ACP5P13686 325 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 AGXTP21549 392 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 RPL13P26373 211 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 SULT1E1P49888 294 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ARG2P78540 354 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 DEUP1Q05D60 604 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 ARTNQ5T4W7 220 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00696Q6ZRV3 163 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 D2HGDHQ8N465 521 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 SHC3Q92529 594 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 FANCEQ9HB96 536 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 AGPSO00116 658 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 HOXC12P31275 282 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1CAP62136 330 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf3-211ENST00000463372 PDCLQ13371 301 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms