RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CNTFP26441 200 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 AKT1P31749 480 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CLDN2P57739 230 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1024LP59773 190 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PFN3P60673 137 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MPP1Q00013 466 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2H3Q13889 308 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PTK2BQ14289 1009 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA3AQ14563 771 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RASA2Q15283 850 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PLK5Q496M5 336 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PMS2CLQ68D20 193 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 IQCHQ86VS3 1027 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TDRPQ86YL5 185 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PELI3Q8N2H9 469 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 BMFQ96LC9 184 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PAFAH2Q99487 392 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOJQ9H4E5 214 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 EBF2Q9HAK2 575 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1A2Q9Y585 309 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 POM121BA6NF01 834 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF10CO14798 259 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LILRB5O75023 590 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH16O75309 829 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PIAS1O75925 651 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT37O76014 449 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK14O94921 469 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 HAUS5O94927 633 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ASMTLO95671 621 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ESR1P03372 595 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR56A5P0C7T3 313 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CD38P28907 300 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 POLD2P49005 469 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 THOP1P52888 689 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 NFATC4Q14934 902 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TEAD4Q15561 434 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZSR6 202 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LPGAT1Q92604 370 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MTBPQ96DY7 904 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR92Q96MX6 357 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A18Q96N87 628 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RBBP8Q99708 897 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2AG1Q9H205 316 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RMI1Q9H9A7 625 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PSAT1Q9Y617 370 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 NFS1Q9Y697 457 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PLXNA2O75051 1894 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GTW7 788 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TLDC2A0PJX2 215 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL33A6NCF5 533 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms