RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MED10Q9BTT4 135 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ADI1Q9BV57 179 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC61Q9BV99 259 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRC4Q9NPP4 1024 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 APPL1Q9UKG1 709 aa4.07□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP83Q9Y592 693 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ARID1AO14497 2285 aa4.07□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC88CQ9P219 2028 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0G2JNJ9 132 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 POM121BA6NF01 834 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC34A8MYJ7 566 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 B4E171 279 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CPLX1O14810 134 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZW10O43264 779 aa4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2G4BP0C869 781 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 GAAP10253 952 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RALAP11233 206 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TSHRP16473 764 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CD70P32970 193 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NNMTP40261 264 aa4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 THOP1P52888 689 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 METAP1P53582 386 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NCKAP1LP55160 1127 aa4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CD69Q07108 199 aa4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF7Q14155 803 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MAN2A1Q16706 1144 aa4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAXCQ5TGI0 409 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM198Q66K66 360 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKS6Q68DC2 871 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ERAP2Q6P179 960 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZVL8 140 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM129CQ86XR2 697 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP97Q8IW35 865 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NAGSQ8N159 534 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ESX1Q8N693 406 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 STPG3Q8N7X2 389 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNN1Q92952 543 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KAT5Q92993 513 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RGMAQ96B86 450 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 HPDLQ96IR7 371 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FEM1CQ96JP0 617 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 BMFQ96LC9 184 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SGCZQ96LD1 299 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXC2Q99958 501 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZPBPQ9BS86 351 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RDH14Q9HBH5 336 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 OSER1Q9NX31 292 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 Q9UFV3 132 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR34Q9UPC5 381 aa4.06□□□□□ -1.76
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