RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-213ENST00000460211 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 NRROSQ86YC3 692 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 PBKQ96KB5 322 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 PAK5Q9P286 719 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 APPL1Q9UKG1 709 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 ARL5AQ9Y689 179 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-213ENST00000460211 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 KMOO15229 486 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 NOBOXO60393 691 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ACP5P13686 325 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 SLC2A4P14672 509 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CXCR5P32302 372 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 OLIG2Q13516 323 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 SPIDRQ14159 915 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CHRNA6Q15825 494 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 KCTD11Q693B1 232 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 PRORYQ9H606 182 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ECEL1O95672 775 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 LAMB3Q13751 1172 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ARL14Q8N4G2 192 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF398Q8TD17 642 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 OR5K4A6NMS3 321 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CHUKO15111 745 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A9O60656 530 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CSO75390 466 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 MTX2O75431 263 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 PRAMEF1O95521 474 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 VCLP18206 1134 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A6P19224 532 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A1P22309 533 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A4P22310 534 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A3P35503 534 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A5P35504 534 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CDH17Q12864 832 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 SEPT6Q14141 434 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 INSCQ1MX18 579 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 CCNJLQ8IV13 435 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 AVL9Q8NBF6 648 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 ASB8Q9H765 288 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 KCNK6Q9Y257 313 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 LRP4O75096 1905 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 SNX2O60749 519 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 KCNJ13O60928 360 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-213ENST00000460211 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms