RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF9O43307 516 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CTAG2O75638 210 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT34O76011 436 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 IL1BP01584 269 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CXCL8P10145 99 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 C5AR1P21730 350 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CIITAP33076 1130 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GNAQP50148 359 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 METAP1P53582 386 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP5P59047 1200 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DMTNQ08495 405 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DMPKQ09013 629 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 UGT8Q16880 541 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CHST9Q7L1S5 443 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ACOT1Q86TX2 421 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 C4orf19Q8IY42 314 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DEPTORQ8TB45 409 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 AZIN2Q96A70 460 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATA17Q96L03 361 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CLPBQ9H078 707 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 APMAPQ9HDC9 416 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RGL1Q9NZL6 768 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 APPL1Q9UKG1 709 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 POM121BA6NF01 834 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CREB3O43889 395 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HMMRO75330 724 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 STC2O76061 302 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 VENTXO95231 258 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PLA2G4BP0C869 781 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GYPEP15421 78 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFBP2P18065 325 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RXRAP19793 462 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP3A5P20815 502 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 BDNFP23560 247 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ALDH4A1P30038 563 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DRD3P35462 400 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NAMPTP43490 491 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CASP6P55212 293 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CDC16Q13042 620 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DNASE1L3Q13609 305 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FAXCQ5TGI0 409 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6ZS92 163 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 P3H2Q8IVL5 708 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 BMPERQ8N8U9 685 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO32Q969P5 355 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 C16orf92Q96LL3 132 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZPBPQ9BS86 351 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 C5AR2Q9P296 337 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 VPS51Q9UID3 782 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TCHHQ07283 1943 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HCRTO43612 131 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms