RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449449.6

TRAF3IP2-AS1-206, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 784 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ACP5P13686 325 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 HGFP14210 728 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A6P19224 532 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 HLA-DPA1P20036 260 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A1P22309 533 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A4P22310 534 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A3P35503 534 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ETV5P41161 510 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ABCG1P45844 678 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CLCNKAP51800 687 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 OLIG2Q13516 323 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PEX6Q13608 980 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CHRNA6Q15825 494 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 AMZ1Q400G9 498 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CCDC181Q5TID7 509 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PIM3Q86V86 326 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SPATA13Q96N96 652 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 VPS35Q96QK1 796 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 APOL2Q9BQE5 337 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 FICDQ9BVA6 458 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 THSD1Q9NS62 852 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 HACD3Q9P035 362 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PDP2Q9P2J9 529 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KCNK6Q9Y257 313 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KCTD3Q9Y597 815 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SDK2Q58EX2 2172 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 AGRPO00253 132 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 GPR39O43194 453 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 EFSO43281 561 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 VEGFDO43915 354 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ANXA9O76027 345 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 METTL18O95568 372 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ITGA2BP08514 1039 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 BRAFP15056 766 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ITIH1P19827 911 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PSMB4P28070 264 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CSF2RBP32927 897 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CETN2P41208 172 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 GEMP55040 296 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KCTD11Q693B1 232 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KLC4Q9NSK0 619 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 A0A0G2JNG1 304 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 AGAP14A8MT82 685 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KMOO15229 486 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 KLK10O43240 276 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SNX2O60749 519 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CDK14O94921 469 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 CCL4P13236 92 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 F3P13726 295 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SLC5A2P31639 672 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SPAM1P38567 509 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SLC19A1P41440 591 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 ARSDP51689 593 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 LIMK2P53671 638 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 XIAPP98170 497 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 SPARCL1Q14515 664 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms