RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 CYP1B1Q16678 543 aa20.27■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 MAPK15Q8TD08 544 aa20.27■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 ZNF778Q96MU6 729 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 TTC25Q96NG3 672 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 ABCG4Q9H172 646 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 CASS4Q9NQ75 786 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.27■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 PPFIA2O75334 1257 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 GAS8O95995 478 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 AKAP13Q12802 2813 aa20.24■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 MROH6A6NGR9 719 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 VEGFDO43915 354 aa20.23■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 C1QTNF9P0C862 333 aa20.23■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 MSH3P20585 1137 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTX4-203ENST00000447419 TMEM63AO94886 807 aa20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 ITGALP20701 1170 aa20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 B4GALNT1Q00973 533 aa20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 BIRC2Q13490 618 aa20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 LRP8Q14114 963 aa20.22■□□□□ 0.83
PTX4-203ENST00000447419 PPP1R7Q15435 360 aa20.22■□□□□ 0.83
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