RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 DNAJB5O75953 348 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 KIAA0754O94854 1291 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ZNF202O95125 648 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PIGNO95427 931 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 CBX6O95503 412 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ASMTLO95671 621 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 DLGAP3O95886 979 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ERBB2P04626 1255 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 CEACAM5P06731 702 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 RNF224P0DH78 156 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 AMD1P17707 334 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 F8A1P23610 371 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ADRA1BP35368 520 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 MMP12P39900 470 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PPP1R2P41236 205 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 FASLGP48023 281 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 NDUFA8P51970 172 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 CDK18Q07002 472 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 NFATC2Q13469 925 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 DNASE1L3Q13609 305 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 LRP8Q14114 963 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PARP15Q460N3 678 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 AFMIDQ63HM1 303 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 DENND2CQ68D51 928 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 LIPIQ6XZB0 460 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 SRLQ86TD4 932 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 FAM131BQ86XD5 332 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 NRROSQ86YC3 692 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 GALNT13Q8IUC8 556 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 NDUFAF2Q8N183 169 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 LMO3Q8TAP4 145 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 PATE1Q8WXA2 126 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 HDAC11Q96DB2 347 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 NUS1Q96E22 293 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 GSDMAQ96QA5 445 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 OR6C1Q96RD1 312 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 TEX101Q9BY14 249 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ACTL8Q9H568 366 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 APMAPQ9HDC9 416 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1-204ENST00000444685 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TSPAN11A1L157 253 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ARGFXA6NJG6 315 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 A6NL46 340 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PRSS44E7EML9 344 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ZNF185O15231 689 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LRRTM2O43300 516 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SNX2O60749 519 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SPAG6O75602 509 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ALPPP05187 535 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PYGLP06737 847 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 IVLP07476 585 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 DESP17661 470 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ADH6P28332 368 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PTPN4P29074 926 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 EPHB2P29323 1055 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SDC4P31431 198 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CSF2RBP32927 897 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 GPR1P46091 355 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CSNK1DP48730 415 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 POLD2P49005 469 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ARL4DP49703 201 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SEPHS1P49903 392 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RENBPP51606 427 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 NDST2P52849 883 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RRADP55042 308 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ITGA1P56199 1179 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CDK3Q00526 305 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 UGT8Q16880 541 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 KCTD16Q68DU8 428 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RAET1GQ6H3X3 334 aa5.08□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 DOK6Q6PKX4 331 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms