RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.66■□□□□ 0.26
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RABGEF1-204ENST00000442563 KCNJ13O60928 360 aa16.65■□□□□ 0.26
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RABGEF1-204ENST00000442563 ITGALP20701 1170 aa16.65■□□□□ 0.26
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RABGEF1-204ENST00000442563 ACTR1AP61163 376 aa16.65■□□□□ 0.26
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RABGEF1-204ENST00000442563 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.65■□□□□ 0.26
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RABGEF1-204ENST00000442563 CA5AP35218 305 aa16.64■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.63■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 B4DGG1 531 aa16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC38Q502W7 563 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PERM1Q5SV97 790 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 NXPE1Q8N323 547 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL14Q8N4G2 192 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPK15Q8TD08 544 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CPT1BQ92523 772 aa16.62■□□□□ 0.25
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