RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SLC39A7Q92504 469 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NODALQ96S42 347 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 RHOJQ9H4E5 214 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NFS1Q9Y697 457 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CACNA1SQ13698 1873 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 M0R233 179 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CHP2O43745 196 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 FAM20BO75063 409 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NDUFS3O75489 264 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 PIGNO95427 931 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 THP07101 528 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 PSEN2P49810 448 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NRG3P56975 720 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NCOA4Q13772 614 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 RAB41Q5JT25 222 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 KCNK18Q7Z418 384 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SUSD6Q92537 303 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 MTMR8Q96EF0 704 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SYT17Q9BSW7 474 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ANGPT4Q9Y264 503 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 UGT2B4P06133 528 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ANXA3P12429 323 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CD6P30203 668 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CHKAP35790 457 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CA9Q16790 459 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 OR52E8Q6IFG1 317 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ING5Q8WYH8 240 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CHFRQ96EP1 664 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 PHOX2BQ99453 314 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 TASP1Q9H6P5 420 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 KCNK13Q9HB14 408 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 KLK14Q9P0G3 267 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ACTR3BQ9P1U1 418 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 DERAQ9Y315 318 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 RGS14O43566 566 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CCNDBP1O95273 360 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ACACAQ13085 2346 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 LLGL1Q15334 1064 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 MIIPQ5JXC2 388 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CERS2Q96G23 380 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 C9orf72Q96LT7 481 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CLCC1Q96S66 551 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 A0A1W2PQ72 361 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 GLTPD2A6NH11 291 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 BCKDKO14874 412 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF185O15231 689 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF432O94892 652 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-203ENST00000381196 GSTT2P0CG29 244 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 HTR2AP28223 471 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 BCAT1P54687 386 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 PPP3R1P63098 170 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 ASPGQ86U10 573 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 UNC93AQ86WB7 457 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 KAT2AQ92830 837 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 SLC35C1Q96A29 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-203ENST00000381196 VMP1Q96GC9 406 aa4.85□□□□□ -1.63
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