RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PARP8	Q8N3A8	854 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ANKFN1	Q8N957	763 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ISOC1	Q96CN7	298 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	FAR2	Q96K12	515 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF145	Q96MT1	663 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	BIRC8	Q96P09	236 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918		H0Y858	1186 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CBX4	O00257	560 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	FFAR3	O14843	346 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	GPR42	O15529	346 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ADAM12	O43184	909 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	MAN1A2	O60476	641 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	SNAP91	O60641	907 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	GUCA1C	O95843	209 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PRL	P01236	227 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	IRF1	P10914	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	GK	P32189	559 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	POLD2	P49005	469 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ACADVL	P49748	655 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	LCP2	Q13094	533 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	DUSP4	Q13115	394 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	DSC3	Q14574	896 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PTGR1	Q14914	329 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	SGO1	Q5FBB7	561 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZSR9	355 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	TEX26	Q8N6G2	289 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	HGH1	Q9BTY7	390 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	NANOG	Q9H9S0	305 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PLK2	Q9NYY3	685 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A0C4DFX4	3053 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CLOCK	O15516	846 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PFDN1	O60925	122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	KCNH1	O95259	989 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	STAMBP	O95630	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	G6PD	P11413	515 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	IL7R	P16871	459 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CTPS1	P17812	591 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	FAS	P25445	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	SHMT2	P34897	504 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ATP6V0D1	P61421	351 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	BNIP3	Q12983	259 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	NKG7	Q16617	165 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	GTDC1	Q4AE62	458 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	DENND1C	Q8IV53	801 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	C10orf111	Q8N326	155 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	TADA1	Q96BN2	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	BIRC7	Q96CA5	298 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	EID2B	Q96D98	161 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	LINGO1	Q96FE5	620 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	TRIB3	Q96RU7	358 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ACTL8	Q9H568	366 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	PCTP	Q9UKL6	214 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CAGE1-203	ENST00000379918	SCML2	Q9UQR0	700 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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