RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 PNLIPP16233 465 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 GLB1P16278 677 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 BPIP17213 487 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LHCGRP22888 699 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KELP23276 732 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 UGT1A5P35504 534 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 INHBCP55103 352 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PPP2R2AP63151 447 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SPRED1Q7Z699 444 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 OR8H2Q8N162 312 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PGBD5Q8N414 524 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC138Q96M89 665 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CRB3Q9BUF7 120 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ZWILCHQ9H900 591 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RP1P56715 2156 aa6.96□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PQ67 120 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PRSS38A1L453 326 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 A8MX80 341 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 B4DGG1 531 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 H3BRJ5 948 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 EFSO43281 561 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CPP00450 1065 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FUCA1P04066 466 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MYBL1P10243 752 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RARAP10276 462 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HGFP14210 728 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ACPPP15309 386 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 AMPD1P23109 780 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SLC5A2P31639 672 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 VIPR1P32241 457 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TRAF2Q12933 501 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF235Q14590 738 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ACOX1Q15067 660 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FIGNQ5HY92 759 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PNCKQ6P2M8 343 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NRROSQ86YC3 692 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NUS1Q96E22 293 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM11Q96F44 468 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 DTD2Q96FN9 168 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TEX101Q9BY14 249 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 STRADBQ9C0K7 418 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NOD2Q9HC29 1040 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.95□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CAPN8A6NHC0 703 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PSMD11O00231 422 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SASH3O75995 380 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PGLSO95336 258 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SOD1P00441 154 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms